Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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