Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms