Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NlkO54949 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NlkO54949 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NlkO54949 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NlkO54949 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NlkO54949 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NlkO54949 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NlkO54949 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms