Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CrxO54751 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms