Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FxnO35943 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FxnO35943 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FxnO35943 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FxnO35943 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FxnO35943 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
FxnO35943 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FxnO35943 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
FxnO35943 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
FxnO35943 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
FxnO35943 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FxnO35943 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FxnO35943 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FxnO35943 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
FxnO35943 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
FxnO35943 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FxnO35943 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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FxnO35943 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FxnO35943 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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FxnO35943 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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FxnO35943 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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FxnO35943 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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FxnO35943 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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FxnO35943 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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