Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

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Length 734 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gp1baO35930 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gp1baO35930 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gp1baO35930 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gp1baO35930 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms