Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Prrt1O35449 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Prrt1O35449 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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