Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pitx3O35160 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms