Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Degs1O09005 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Degs1O09005 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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