Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PbsnO08976 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PbsnO08976 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms