Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm21900J3QP38 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm21900J3QP38 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm21900J3QP38 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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