Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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