Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3415J3QMS8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms