Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms