Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm21060J3KMU4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm21060J3KMU4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm21060J3KMU4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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