Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms