Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Igkv1-99F6XWB2 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms