Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gm10378F6XQQ1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gm10378F6XQQ1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gm10378F6XQQ1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gm10378F6XQQ1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gm10378F6XQQ1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm10378F6XQQ1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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