Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd35E9Q9D8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd35E9Q9D8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd35E9Q9D8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd35E9Q9D8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd35E9Q9D8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd35E9Q9D8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd35E9Q9D8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd35E9Q9D8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd35E9Q9D8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd35E9Q9D8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd35E9Q9D8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd35E9Q9D8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd35E9Q9D8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd35E9Q9D8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd35E9Q9D8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd35E9Q9D8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd35E9Q9D8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms