Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf169E9Q7F2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms