Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm20518E9Q548 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm20518E9Q548 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm20518E9Q548 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm20518E9Q548 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20518E9Q548 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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