Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm9972E9Q053 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm9972E9Q053 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm9972E9Q053 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm9972E9Q053 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm9972E9Q053 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm9972E9Q053 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm9972E9Q053 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm9972E9Q053 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms