Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms