Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc6D3YZP9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms