Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm17333C6EQI3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm17333C6EQI3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm17333C6EQI3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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