Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms