Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clrn2B2RVW2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms