Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms