Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apol7aB2RT54 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms