Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf518bB2RRE4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf518bB2RRE4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf518bB2RRE4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf518bB2RRE4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf518bB2RRE4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf518bB2RRE4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf518bB2RRE4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Znf518bB2RRE4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Znf518bB2RRE4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Znf518bB2RRE4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Znf518bB2RRE4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Znf518bB2RRE4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Znf518bB2RRE4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf518bB2RRE4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms