Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Skint8A7XV07 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Skint8A7XV07 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms