Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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