Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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