Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Lcn6A2AJB9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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