Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms