Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm5538W4VSP6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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