Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Top3bQ9Z321 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Top3bQ9Z321 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Top3bQ9Z321 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Top3bQ9Z321 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Top3bQ9Z321 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Top3bQ9Z321 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Top3bQ9Z321 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Top3bQ9Z321 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Top3bQ9Z321 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Top3bQ9Z321 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms