Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Homer1Q9Z2Y3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms