Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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