Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms