Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn6Q9Z262 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms