Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms