Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip6Q9Z1Y4 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms