Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms