Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms