Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cldn13Q9Z0S4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn13Q9Z0S4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms