Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip1Q9WUU8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms