Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Psma1Q9R1P4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psma1Q9R1P4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms