Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr54Q9R0D8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms