Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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AmfrQ9R049 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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AmfrQ9R049 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AmfrQ9R049 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AmfrQ9R049 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AmfrQ9R049 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AmfrQ9R049 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AmfrQ9R049 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AmfrQ9R049 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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AmfrQ9R049 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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AmfrQ9R049 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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AmfrQ9R049 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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AmfrQ9R049 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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